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La surveillance des phycotoxines dans les coquillages du milieu marin. Le réseau REPHY : objectifs, stratégies, et principaux résultats ArchiMer
Belin, Catherine.
The surveillance of phycotoxins in marine shellfish. The REPHY network: objectives, strategies and primary results One of the objectives of REPHY (network for phytoplankton and phycotoxin surveillance) is to monitor toxin-producing micro-algae species in the marine environment that are likely to accumulate in seafood products, and to screen for these toxins in shellfish. This surveillance is undertaken in the framework of the European regulations. Three groups of toxins are thus monitored and are associated with three genera of toxic phytoplankton: (i) Dinophysis, a producer of the okadaic acid (with diarrhoeic effects) and pectenotoxin families of toxins; in the same group of so-called “lipophilic toxins”, two other families of regulated toxins are...
Tipo: Text Palavras-chave: Santé; Surveillance; Phytoplancton; Phycotoxines; Coquillages; Milieu marin; Health; Surveillance; Phytoplankton; Phycotoxins; Shellfish; Marine environment.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00449/56089/57623.pdf
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Le maximum saisonnier de Dynophysis cf acuminata à Antifer (Normandie, France) ArchiMer
Lassus, Patrick; Maggi, Pierre; Proniewski, F.; Truquet, Philippe; Bardouil, Michele.
Since 1987 Antifer oil tanker terminal (Normandy, France) was weIl known, as a preferential area for summer highest blooms of Dinophysis cf acuminata, a toxic dinoflagellate. Three oceanographic cruises were made in August 1989, before, in the course of and after the seasonal max. of this species. Results obtained from these cruises (hydrological parameters and phytoplankton) as weIl as from a daily survey at a reference station in Antifer harbour, corrobora te the prevailing role of coastal up flowing of Seine estuarine waters, pushed to the coast by a dominant S - SW wind, on intensity and duration of Dinophysis bloom. Such observations are in agreement with those of Summer 1987 at reference station.
Tipo: Text Palavras-chave: Antifer; Dinophysis; Hydrologie; Phytoplancton; Antifer; Dinophysis; Hydrology; Phytoplankton.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00138/24946/23039.pdf
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Le satellite en soutien à la conchyliculture ArchiMer
Le Moine, Olivier; Gohin, Francis.
La surveillance de la qualité des eaux littorales assurée par l'IFREMER s'est enrichie de données satellitaires. L'IFREMER a développé un algorithme de traitement de ces données permettant l'évaluation de la richesse phytoplanctonique des eaux et leur cartographie. Les données sources sont les données de réflectance du satellite MODIS (Goddard Space Center, NASA). Le réseau REPHY de surveillance de la flore vient conforter ces résultats. Ces estimations aident à la compréhension de l'écosystème, et à l'explication des croissances et rendements des bivalves en élevage, mission des Laboratoires Environnement Ressource de l'IFREMER.
Tipo: Text Palavras-chave: Bivalves; Croissance; Phytoplancton; Traitement données; Satellite; Conchyliculture.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-4083.pdf
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L'élevage conchylicole sur filière : revue bibliographique ArchiMer
Robert, Stephane; Prou, Jean; Le Moine, Olivier; Taillade, Sylvie.
La revue bibliographie de l'élevage conchylicole sur filière permet de situer l'évolution de cette technique en France et dans le monde. Elle regroupe les travaux disponibles tant sur les méthodes et les techniques, que sur les contraintes biologiques et environnementales qui conditionnent ce type d'élevage. Les techniques d'élevage conchylicole sur filières sont directement dépendantes de l' environnement disponible. Si l'élevage sur filière de surface nécessite des zones protégées peu disponibles sur le littoral atlantique, la filière de sub-surface correspond mieux aux possibilités de développement en site semi-abrité tels que les Pertuis charentais. L'élevage en filières immergées permet d'envisager la recherche de nouveau espace en mer ouverte comme...
Tipo: Text Palavras-chave: Algue toxique; Bioaccumulation; Capacité trophique; Compétiteur; Densité élevge; Elevage en suspendu; Filière; Eutrophisation; Génétique; Matière particulaire; Mer ouverte; Mortalité; Phytoplancton; Pollution; Production primarie; Technique élevage; Transfert de biotope.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00074/18510/16050.pdf
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Les communautés du phytoplancton. Sous-région marine Golfe de Gascogne. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Belin, Catherine; Haberkorn, Hansy; Ménesguen, Alain.
Tipo: Text Palavras-chave: Golfe de Gascogne; Phytoplancton; Communautés; Fréquence des blooms; Modélisation écologique.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00329/44014/43586.pdf
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Les dinophycées pélagiques et benthiques du Golfe de Gascogne sud de la Bretagne à Arcachon ArchiMer
Paulmier, Gerard.
Les microphytes planctoniques et benthiques du Golfe de Gascogne sont relativement diversifiés. Cette diversification est probablement en rapport avec la situation hydrologique particulière de cette région enrichie par des mélanges de masses d'eau de diverses origines et par des apports continentaux importants. Dans ce contexte, les dinophycées sont nombreuses et variées et occupent toutes les niches écologiques. 230 taxons ont été répertoriés. Quelques espèces sont connues pour provoquer périodiquement des colorations de la mer "eaux rouges" et quelques-unes sont maintenant redoutées pour leur toxicité.
Tipo: Text Palavras-chave: Zone pélagique; Zone benthique; Phytoplancton; Diversité espèces; Niche écologique; Inventaire floristique; Cycle développement; Répartition géographique; Morphologie; Pyrrophycophyta; Golfe de Gascogne; Bretagne; Landes; Algae; Thallophyta; Océan Atlantique Nord; Océan Atlantique; France; Europe; Aquitaine; Pelagic zone; Benthic zone; Phytoplankton; Species diversity; Niche; Floral survey; Life cycle; Geographic distribution; Morphology; Pyrrophycophyta; Bay of Biscay; Bretagne; Landes; Algae; Thallophyta; North Atlantic; Atlantic Ocean; France; Europe; Aquitaine.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00260/37097/35613.pdf
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Les espèces phytoplanctoniques toxiques et nuisibles sur le littoral français de 1984 à 1995, résultats du REPHY (réseau de surveillance du phytoplancton et des phycotoxines) ArchiMer
Belin, Catherine; Raffin, Bernard.
This document presents the results obtained through the French Phytoplankton and Phycotoxins Monitoring Network (REPHY), concerning the presence of toxic and harmful phytoplankton species along the French coast, from 1984 to 1995. The network REPHY is briefly described. Then the different species, and their associated events, are reviewed : first, species toxic to shellfish consumers, e.g. Dinophysis spp. and Alexandrium minutum, which respectively produce diarrheic and paralytic toxins ; then, species which are toxic or harmful for marine fauna (fish, shellfish). The monitoring results are preceded by the main knowledge on taxonomy, distribution, biology, ecology and toxicity of the concerned species. A final synthesis illustrates the distribution of...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Phycotoxines; Surveillance; Espèces toxiques; Espèces nuisibles; Dinophysis; Alexandrium; DSP; PSP; Secteurs fermés; Phytoplankton; Phcotoxins; Monitoring; Toxic species; Harmful species; Dinophysis; Alexandrium; DSP; PSP; Closed areas.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00094/20514/18184.pdf
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Maitrise de la culture de masse de la diatomée Skeletonema costatum en système ouvert et continu sur un milieu en "eau de mer" ArchiMer
Brossard, Nicolas; Hussenot, Jerome.
Une culture extérieure en masse de la diatomée Skeletonema costatum, en système ouvert et continu, a été réalisée en automne 1996, au marais expérimental du CREMA I'Houmeau. Le but était d'apporter une nourriture complémentaire aux huîtres en période d'affinage.
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Microalgues; Diatomées; Skeletonema costatum; Culture de masse; Culture continue; Affinage d'huîtres; Phytoplankton; Diatoms; Skeletonema costatum; Mass culture; Continuous culture; Oyster fattening.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00020/13117/10126.pdf
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Manuel pour l’utilisation des données REPHY. Informations destinées à améliorer la compréhension des fichiers de données REPHY mis à disposition des scientifiques et du public ArchiMer
Ifremer, ODE/VIGIES, Coordination REPHY & Cellule Quadrige.
Le REPHY (Réseau d’Observation et de Surveillance du Phytoplancton et de l’Hydrologie dans les eaux littorales) est un réseau mis en oeuvre par Ifremer. Les données acquises par le REPHY sont bancarisées depuis 1987 dans la base de données Quadrige. Ce manuel est destiné aux utilisateurs des données REPHY, qui sont disponibles à partir de plusieurs supports, en particulier : Quadrige², SURVAL et SEANOE. La base de données Quadrige est une composante du Système d'Information sur l'Eau (SIE) et a pour mission la gestion et la valorisation des données issues de nombreux réseaux de surveillance du littoral. L’accès direct aux données REPHY via l’applicatif Quadrige est réservé aux utilisateurs autorisés. Le produit SURVAL est un des outils appartenant au SI...
Tipo: Text Palavras-chave: REPHY; Données; Quadrige; SURVAL; SEANOE; DOI; Phytoplancton; Hydrologie; Mesures physicochimiques; Eaux littorales.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00409/52016/52666.pdf
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Méthodes  de  bio‐indication  en  eaux  littorales.  Indicateur  phytoplancton  et  physico‐chimie.  Livrable A2 : Synthèse des conclusions du GT phytoplancton ‐ hydrologie. Validation intermédiaire des  grilles biomasse dans les MET de Manche Atlantique. Révision de la définition des masses  d'eau turbides pour la prise en compte de l'indicateur phytoplancton  ArchiMer
Belin, Catherine; Daniel, Anne.
La réunion du Groupe de travail Phytoplancton ‐ Hydrologie 2012, du 17 décembre 2012, a conduit à deux recommandations. La première recommandation concerne la définition des masses d'eau turbides. En effet, la liste de masses d'eaux turbides actuellement utilisée pour l'évaluation phytoplancton n'est pas satisfaisante, car absolument pas homogène d'une région à l'autre, et souvent en contradiction avec le typologie DCE. il est donc proposé de partir de la typologie existante pour la DCE, en la nuançant d’avis d’experts dans les cas où elle n’est pas totalement satisfaisante. Cette nouvelle définition des ME turbides, réalisée selon des critères plus homogènes sur l'ensemble du littoral, sera utilisée pour la prochaine évaluation de l'indicateur...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; Indice biomasse; Chlorophylle; Turbidité; Masses d'eau de transition; Manche Atlantique.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00212/32358/30811.pdf
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Micro-algues des claires ostréicoles de Charente Maritime : focus sur les producteurs potentiels de toxines DSP, PSP et ASP et toxines émergentes (palytoxines, pinnatoxine...) ArchiMer
Mertens, Kenneth; Chomerat, Nicolas; Nezan, Elisabeth; Bruneau, Audrey; Le Bec, Claude.
Les inspections vétérinaires de la Commission Européenne ayant signifié à la France son constat d'une absence de réserau de surveillance sur les claires ostréicoles, la DGAL a mandaté l'Ifremer afin de réaliser un premier diagnostic sur le phytoplancton. Cette commande de la DGAL place l'Ifremer LERBO comme prestataire de service et spécialiste des micro-algues. Les claires ostréicoles étant hors du domaine public maritime, une concertation avec le Comité Régional de la Conchyliculture de Poitou-Charentes, la DGAL et la DDTM 17 en juin 2018 a permis de proposer six claires, réparties entre l'île de Ré et l'île d'Oléron et pouvant être échantillonnées. L'objectif est de faire un état des lieux de la présence ou de l'absence de cellules de phytoplancton...
Tipo: Text Palavras-chave: Charentes; Claire; Phytoplancton; Micro-algue; Toxine.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00486/59731/62828.pdf
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Modélisation 0D des efflorescences d'Alexandrium en rade de Brest en compétition inter-spécifique ArchiMer
Le Gland, Guillaume.
Since 2010, planktonic algae Alexandrium minutum, cause of the PSP (Paralytic Shellfish Poisoning) syndrome, has been proliferating in early summer in the bay of Daoulas, within the roadstead of Brest. During this internship, a model has been designed in order to derive these blooms from physical parameters (temperature, irradiance, nutrient supply, dilution rate …). In the model, A.minutum competes with 50 other plankton species with randomly attributed optimal temperature and nutrient uptake abilities. It turns out to reproduce well the bloom of 2012, with a correct date of maximum concentration and a relevant order of magnitude. It reproduces the order of magnitude of 2013 concentrations, but the bloom then is too spread in time around the maximum....
Tipo: Text Palavras-chave: Alexandrium minutum; Phytoplancton; Efflorescence (bloom); Nutriments; Lumière; Température; Dilution; Absorption (uptake); Quota cellulaire; Croissance; Compétition; Modèle; Rade de Brest.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00209/32004/30442.pdf
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Modélisation de la production ostréicole à Marennes-Oléron : introduction d'un modèle de croissance phytoplanctonique ArchiMer
Raillard, Olivier.
La complication d'un modèle déterministe est une action qui ne peut être envisagée sans raisons impérieuses. En plus des mécanismes nouveaux qu'il importe de connaître précisément pour les formaliser correctement, l'introduction de nouveaux paramètres, dont la valeur exacte n'est jamais connue, accroit l'incertitude du modèle (Klepper et Scholten, 1988) et affecte ainsi sa robustesse (Swartzman et Kaluzny, 1987). A Marennes-Oléron, l'introduction d'un modèle de production primaire doit permettre d'aborder les problèmes suivants : Quelle est véritablement l'impact des débits de la Charente sur la production ostréicole? ou plus précisément : les nutriments d'origine charentaise contrôlent-ils la production phytoplanctonique du bassin et par voie de...
Tipo: Text Palavras-chave: Modélisation; Croissance; Phytoplancton; Modèle biologique; Bassin de Marennes Oléron; Charente Maritime.
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00102/21313/18932.pdf
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Modélisation de l'écosystème du bassin de Marennes-Oléron (Rapport 1991) ArchiMer
Raillard, Olivier; Razet, Daniel; Prou, Jean; Heral, Maurice.
Les expérimentations en continu sur le site du Chapus au centre du bassin de Marennes-Oléron pendant le mois de mai 1990 ont permis de déterminer le comportement des huîtres (filtration et ingestion). Dans le bassin de Marennes-Oléron les huîtres sont toujours au-dessus du seuil de production de pseudofeces qui régulent la qualité de nourriture ingérée. Ces résultats démontrent par ailleurs qu'il existe nettement un tri du matériel particulaire en suspension. Les huîtres rejettent préférentiellement le matériel minéral dans les pseudofeces alors que le matériel qui transite dans le tractus digestif est enrichi en matière organique. Un modèle trophique des huîtres a ainsi pu être établi avec de nouvelles lois de tri de la matière particulaire. Parallèlement...
Tipo: Text Palavras-chave: Séries en continu; Turbidité; Phytoplancton; Physiologie huître Crassostrea gigas; Modèle de croissance; Modèle de remise en suspension.
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00095/20635/18266.pdf
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Observations préliminaires recueillies dans l'exécution des programmes entrepris par la station biologique de Roscoff ArchiMer
Bergerard, S..
We have tried to expose here the first observations on the basis of , previous knowledge and studies in progress when the wreck arrived, in particulary of benthic Populations Dynamics by the workers of the Biological Station. These results, still very fragmentary, allow never the less to definite the programs required for the second phase, essentially on the populations of fine deposits of the Morlaix and Lannion bays.
Tipo: Text Palavras-chave: Pollution; Hydrocarbures; Amoco Cadiz; Sédiments; Phytoplancton; Macrobenthos; Meiobenthos; Microbenthos; Baie de Morlaix; Baie de Lannion; Pollution; Hydrocarbons; Amoco Cadiz; Sediments; Phytoplancton; Macrobenthos; Meiobenthos; Microbenthos; Morlaix Bay; Lannion Bay.
Ano: 1978 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00306/41725/40936.pdf
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Observations sur le phytoplancton du bassin d'Arcachon en période estivale. Rôle potentiel dans la nutrition des larves de Crasssostrea gigas ArchiMer
Maurer, Danièle; His, Edouard; Robert, René.
Des observations sur le phytoplancton du bassin d'Arcachon pendant l'été 1982, montrent une dominance du nanoplancton jusqu'à la fin août, succédant à une floraison micro-planctonique printanière. Ce nanoplancton présente des caractéristiques qui le rendent susceptible d'avoir servi à l'alimentation des larves de Crasssostrea ggias qui se sont très bien développées dans la baie au cours de cette saison de reproduction.
Tipo: Text Palavras-chave: Ostréiculture; Phytoplancton; Nutrition; Huîtres; Bassin Arcachon; Gironde.
Ano: 1984 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00009/12000/8693.pdf
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OBSLAG 2016 - volet eutrophisation. Etat DCE des lagunes méditerranéennes (eau et phytoplancton, période 2011-2016). Développement d’indicateurs de tendance et de variabilité ArchiMer
Derolez, Valerie; Gimard, Antonin; Munaron, Dominique; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Fortune, Martine; Poirrier, Samuel; Mortreux, Serge; Guillou, Jean-louis; Brun, Melanie; Provost, Charlotte; Hatey, Elise; Bec, Béatrice; Malet, Nathalie; Fiandrino, Annie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2016 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2011-2016 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne sont...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49744/50277.pdf
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OBSLAG 2018 - volet eutrophisation. Lagunes méditerranéennes (période 2013-2018). Etat DCE de la colonne d'eau et du phytoplancton, tendance et variabilité des indicateurs ArchiMer
Derolez, Valerie; Bec, Béatrice; Munaron, Dominique; Foucault, Elodie; Fiandrino, Annie; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Hatey, Elise; Connes, Coralie; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Fortune, Martine; Mortreux, Serge; Serais, Ophelie; Crottier, Anais; Malet, Nathalie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2018 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival en 2018 du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2013-2018 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Eutrophisation; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00507/61862/65959.pdf
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Optimisation de l'affinage en claires traditionnelles par une complémentation en phytoplancton "fourrage" ArchiMer
Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Razet, Daniel; Soletchnik, Patrick; Faury, Nicole; Goulletquer, Philippe.
Experiments, carried out from 5 October to 6 December 1995, were done to determine if trophic capacity of traditional oyster ponds increases after adding phytoplankton cultured with mineral enrichment.
Tipo: Text Palavras-chave: Marennes Oléron; Phytoplancton; Claires ostréicoles; Capacité trophique.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3259.pdf
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Optimisation de l’identification et du dénombrement du microphytoplancton avec le système couplé de numérisation et d’analyse d’images FlowCAM – Zoo/PhytoImage (système innovant) ArchiMer
Grosjean, Philippe; Wacquet, Guillaume.
This report details the work accomplished to enhance the Zoo/PhytoImage software to optimize its use for the analysis of phytoplankton samples in general, but more particularly, in the framework of an operational survey of coastal seawater (REPHY, IFREMER). Zoo/PhytoImage allows to analyze “numerically recorded” plankton samples, that is, by using digital images gathered with specialized devices such as the FlowCAM, or the FastCAM (see report 3). A machine learning approach allows to automatically classify the digitized particles into various taxonomic groups. Once this is done, global statistics are calculated on each sample, including the number of particles, the biomass, and the size spectrum per taxonomic group. Two major changes are introduced in the...
Tipo: Text Palavras-chave: Phytoplancton; REPHY; Analyse d'image; Classification supervisée; Dénombrement de cellules; Apprentissage actif; Manche; Atlantique.; Phytoplankton; REPHY; Image analysis; Machine learning; Cells enumeration; Active learning; The Channel; Atlantic Ocean.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00389/49990/50578.pdf
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